Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm4T1NXB5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms