Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Robo3Q9Z2I4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms