Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mbd3Q9Z2D8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms