Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd4Q9Z2D7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms