Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lgr5Q9Z1P4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms