Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms