Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms