Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NgfrQ9Z0W1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NgfrQ9Z0W1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NgfrQ9Z0W1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms