Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms