Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pacsin2Q9WVE8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms