Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme3Q9WV85 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms