Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ptpn4Q9WU22 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ptpn4Q9WU22 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ptpn4Q9WU22 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ptpn4Q9WU22 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ptpn4Q9WU22 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ptpn4Q9WU22 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ptpn4Q9WU22 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ptpn4Q9WU22 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ptpn4Q9WU22 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptpn4Q9WU22 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn4Q9WU22 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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