Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms