Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms