Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms