Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms