Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms