Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf346Q9R0B7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms