Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms