Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms