Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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