Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms