Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcf1Q9QZM3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms