Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnt3Q9QZ47 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms