Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phtf1Q9QZ09 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phtf1Q9QZ09 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms