Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxe3Q9QY14 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms