Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nufip1Q9QXX8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms