Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Kcnip3Q9QXT8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Kcnip3Q9QXT8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Kcnip3Q9QXT8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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