Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trp53inp1Q9QXE4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms