Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms