Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc5Q9QX29 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms