Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms