Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms