Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms