Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms