Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2bQ9JME9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms