Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfmbt1Q9JMD1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms