Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLZ8

Sigirr, Single Ig IL-1-related receptor, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SigirrQ9JLZ8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SigirrQ9JLZ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SigirrQ9JLZ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms