Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cabp1Q9JLK7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cabp1Q9JLK7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms