Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Tgm1Q9JLF6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tgm1Q9JLF6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tgm1Q9JLF6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tgm1Q9JLF6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Tgm1Q9JLF6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Tgm1Q9JLF6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms