Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scamp4Q9JKV5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms