Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ybx3Q9JKB3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ybx3Q9JKB3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms