Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msgn1Q9JK54 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms