Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnga3Q9JJZ8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnga3Q9JJZ8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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