Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms