Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfra4Q9JJT2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfra4Q9JJT2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms