Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpf2Q9JJ80 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms