Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc6l2Q9JIM3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc6l2Q9JIM3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms