Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EefsecQ9JHW4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms