Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RabggtaQ9JHK4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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RabggtaQ9JHK4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RabggtaQ9JHK4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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